В этом докладе, я покажу, почему эволюционные транспозиции так сложны для анализа. В частности, мы увидим, что взвешенное геномное расстояние, предложенное для ограничения пропорции транспозиций в реконструированных сценариях перестроек геномов, на самом деле не достигает своей цели. Далее я опишу, как присутствие эволюционных транспозиций влияет на реконструкцию DCJ-сценариев между данными геномами. В заключение будут представлены два вычислительных метода для количественной оценки пропорции транспозиций среди всевозможных геномных перестроек, произошедших между двумя данными геномами в процессе эволюции.